194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1859 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
176 aa  357  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.23 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.55 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.84 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.29 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  24.71 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  25.28 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.4 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.9 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.14 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  35.59 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.55 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.56 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.68 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  24 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.14 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.99 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.41 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.3 
 
 
228 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.14 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  24.16 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.14 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.97 
 
 
227 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.73 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.43 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.14 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.14 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.89 
 
 
217 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.34 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.26 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.17 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.7 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.16 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.52 
 
 
216 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.42 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.86 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  24.16 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  22.47 
 
 
201 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.6 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  28 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.3 
 
 
182 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.81 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.95 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.36 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.03 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.14 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.7 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.85 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.43 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.14 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.65 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  26.62 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.99 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  25.14 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.99 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.47 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.42 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  23.6 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.58 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.47 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.42 
 
 
196 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.61 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  27.19 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.14 
 
 
398 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.36 
 
 
372 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  22.78 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  27.81 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  23.13 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.99 
 
 
386 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.14 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  34.55 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.72 
 
 
184 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 
183 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  25 
 
 
160 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
160 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  32.23 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.56 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  30.25 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  26.05 
 
 
225 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  27.04 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.71 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.91 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  34.96 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>