105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5191 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  82.83 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  64.29 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  63.41 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  57.65 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  60.24 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  39.89 
 
 		 409 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.61 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  44.32 
 
 		 181 aa  84.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  47.13 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.05 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  52.94 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  48.48 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.24 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.47 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  38.38 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  51.47 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  44 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.12 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  38.38 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.67 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  42.35 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.3 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.48 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.67 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.75 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.67 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  38 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  38.37 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.68 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  45.1 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.05 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  33.94 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  39.58 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.16 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.37 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  41.89 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  41.89 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.65 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.9 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.23 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.52 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  34.52 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  34.52 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.86 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.29 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.39 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.31 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  32.04 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.21 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.21 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.68 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  38.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  38.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  29.03 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.84 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.82 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.82 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.82 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 		 108 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.66 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.94 
 
 		 109 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 		 200 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  33.87 
 
 		 101 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 182 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.09 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  27.66 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>