168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6333 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  98.48 
 
 		 207 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  97.87 
 
 		 188 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  76.19 
 
 		 189 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  73.4 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  64.55 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  62.5 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  58.24 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  57.69 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  57.14 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  58.01 
 
 		 186 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  55.06 
 
 		 182 aa  185  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  37.1 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  35.91 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  37.91 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  34.1 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.15 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  36.05 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  32.42 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36.93 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.07 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  34.1 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  33.91 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.76 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.34 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.35 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  29.55 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.83 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.57 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.79 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.33 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.33 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.91 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.91 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  30.34 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.06 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  34.29 
 
 		 409 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.38 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  33.64 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  25.57 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.24 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.34 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.12 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.79 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.38 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.85 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.75 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.15 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.71 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.88 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  26.86 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.77 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.86 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  30.41 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.58 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.01 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25.48 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.32 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.64 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.67 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.74 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.88 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  25.7 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  23.43 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.27 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.74 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.82 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.73 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.47 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.46 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.15 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  24.49 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.98 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.18 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>