184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3520 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  71.98 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  58.13 
 
 		 189 aa  201  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.72 
 
 		 191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  38.51 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  39.43 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.73 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  38.2 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  38.24 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  36.47 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  35.67 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.72 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  34.3 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  34.68 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  33.94 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.94 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  33.92 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  33.92 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  35.33 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.95 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  30.49 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.32 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.8 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  33.12 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.18 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.08 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  32.2 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.97 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.2 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.74 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.1 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.59 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.38 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.14 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.92 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.81 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.99 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.99 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.99 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.54 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.13 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  33.76 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.82 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  32.53 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.82 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  36.75 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.45 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  32.34 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  35.54 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  28.65 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.75 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.11 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.51 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  33.96 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  29.78 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.76 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.65 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  29.68 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.94 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.17 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  30.52 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.09 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.06 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.1 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.15 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  26.55 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  25.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.49 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.86 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.66 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.34 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  25.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.7 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.77 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25.68 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  26.39 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  29.71 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>