129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2790 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
182 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.87 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.46 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.49 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.07 
 
 
178 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  35.98 
 
 
172 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.53 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  33.53 
 
 
172 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  33.95 
 
 
177 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.95 
 
 
177 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.15 
 
 
184 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  35.12 
 
 
172 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
177 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  36.18 
 
 
183 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.11 
 
 
172 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  33.55 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.69 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  30.29 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.13 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.9 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 
192 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.85 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  28.86 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.3 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.65 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.29 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.89 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  28.81 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.53 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.13 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  27.92 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.03 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.3 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.95 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.42 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  24.39 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.56 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.19 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.86 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.03 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  28.21 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.45 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.46 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  32.69 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.93 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  26.59 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.1 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.1 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.37 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.66 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  29.05 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  24.29 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  24.57 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  29.38 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  25.14 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  27.7 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  24.42 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  26.85 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  22.88 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.33 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.66 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.09 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  24.56 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.29 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.67 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.86 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  21.43 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  21.92 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.32 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.31 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  26.53 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  24.69 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  27.08 
 
 
199 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.68 
 
 
196 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.69 
 
 
217 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  24.14 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.53 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.14 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.22 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.92 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.84 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>