169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7158 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  63.28 
 
 		 178 aa  256  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.54 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.54 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.74 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  38.92 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.05 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.28 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.23 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.63 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.53 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  33.9 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  30.18 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  39.75 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.91 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.93 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  34.66 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.39 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  35.85 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  36.6 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  32.18 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.54 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  30.23 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  32.91 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.53 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.91 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  32.91 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.46 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.11 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  32.91 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.52 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.92 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.51 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.78 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  27.72 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.76 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  30.46 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.1 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  28.49 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.08 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  30.82 
 
 		 178 aa  84.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  34.9 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.22 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  32.19 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.99 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  26.74 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  31.51 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.66 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  27.03 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  27.39 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  27.74 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  29.31 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.61 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.74 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.12 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.31 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.09 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  27.89 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  27.85 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.44 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.18 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.88 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  27.68 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  24.85 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  25.49 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.79 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  25.28 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  24.66 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  31.68 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.51 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.64 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.51 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.36 
 
 		 217 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.5 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  25.74 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>