183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4242 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.44 
 
 		 178 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.54 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.44 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.24 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.49 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.26 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.15 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.31 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.57 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.26 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.66 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  39.22 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  36.48 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.76 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.29 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  36.48 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.18 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  33.53 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.53 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.14 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.9 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.46 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.58 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.95 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.18 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  30.46 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.44 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.74 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.8 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.8 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.4 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  35.03 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.61 
 
 		 225 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  30.51 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.25 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  31.07 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.98 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.85 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  26.16 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.09 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.01 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  31.82 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  25.58 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.01 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  27.91 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.75 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.41 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.12 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.85 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  25.48 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  24.42 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.16 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  25.16 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  23.57 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  24.66 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  31.65 
 
 		 409 aa  67.8  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  24.14 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  24.26 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  24.66 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  29.46 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  24.4 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  28.85 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25.42 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.7 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.37 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.46 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.46 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.01 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.47 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.43 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.71 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.1 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>