206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6296 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  74.44 
 
 
180 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  54.94 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.32 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  54.32 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.72 
 
 
179 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.72 
 
 
179 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.05 
 
 
184 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  41.57 
 
 
177 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.37 
 
 
178 aa  124  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  40.22 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.22 
 
 
182 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 
183 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.64 
 
 
172 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  37.64 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.31 
 
 
181 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 
184 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.57 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.33 
 
 
172 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  35.67 
 
 
178 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.75 
 
 
172 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  38.67 
 
 
172 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  35.39 
 
 
172 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.48 
 
 
225 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  35.2 
 
 
177 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.07 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.77 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.75 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.84 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.15 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.71 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.68 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 
183 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  36.67 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.67 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.41 
 
 
179 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.72 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.44 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.46 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.56 
 
 
227 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.44 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.68 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.53 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.53 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.86 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  30.41 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  30.41 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.21 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  31.51 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  30 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.67 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.11 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.21 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  30.52 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  28.16 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
409 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.08 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  29.14 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  29.71 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  30.41 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  29.55 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.07 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.7 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.59 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  26 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  30.41 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.65 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  25.33 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  23.86 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  27.93 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.86 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.28 
 
 
228 aa  58.2  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.53 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.86 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.78 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  24.02 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.42 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.17 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.22 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.42 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  22.29 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.83 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.74 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>