170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0515 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  77.53 
 
 		 178 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.54 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.44 
 
 		 184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.06 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.46 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.27 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  34.27 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  36.71 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.36 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  36.54 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.08 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  37.34 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  35.95 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.96 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.14 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.86 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  31.03 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.43 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 		 179 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.54 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 		 197 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  32.07 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.74 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  32.77 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  33.74 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  32.78 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  30.29 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.48 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  30.18 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.55 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.57 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.37 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.49 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.39 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.97 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.97 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  29.07 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  29.89 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.12 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.92 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  27.91 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  30.51 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  27.33 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.11 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.41 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  27.17 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.24 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.21 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.33 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  25.58 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.38 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  28.57 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.16 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  25.77 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.03 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  23.84 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  24.12 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.85 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.55 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  26.38 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  29.17 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.78 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  23.84 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.56 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.7 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  25.81 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  26.35 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.89 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  30.49 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.71 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  23.81 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.35 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.81 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.21 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>