224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1524 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.8 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.44 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.95 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  59.44 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  58.33 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.88 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  57.89 
 
 		 409 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.82 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.38 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.26 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  45.56 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.29 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  45.4 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  41.48 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.33 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.91 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.32 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.28 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  43.68 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.53 
 
 		 172 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  41.95 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  43.27 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  45.57 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.77 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  46.89 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.77 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.42 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.12 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.81 
 
 		 211 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.14 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.1 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.89 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.53 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  34.3 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.53 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  34.3 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.06 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.37 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  39.62 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.27 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  35.56 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.61 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.71 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  34.1 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.78 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  35.91 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.12 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.39 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.29 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  31.11 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  35.33 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  34.09 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.2 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.82 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  29.48 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  33.76 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  29.12 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.76 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.76 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  28.65 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  29.78 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  26.59 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  26.29 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.06 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  25.56 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  28.82 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.47 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.24 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.73 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.24 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.82 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.88 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.65 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  24.71 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.88 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.97 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.41 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.12 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.47 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.17 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>