107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4052 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  67.22 
 
 		 180 aa  261  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  63.33 
 
 		 184 aa  257  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  62.43 
 
 		 184 aa  254  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  65.56 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  63.54 
 
 		 185 aa  250  8.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  62.36 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  63.33 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  68.38 
 
 		 151 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.7 
 
 		 197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  43.89 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  37.02 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  37.36 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  37.02 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.36 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.75 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.81 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.26 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.42 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  32.78 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  33.71 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.22 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  27.62 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.44 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  32.42 
 
 		 198 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.79 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.55 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.01 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.11 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.27 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.16 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.31 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  29.31 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.16 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.48 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.74 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  27.47 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.01 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.35 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.82 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  29.81 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.24 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.9 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.55 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  25.68 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.91 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.07 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  28.82 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.86 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.37 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.11 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  25.99 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.3 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.42 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  26.42 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  25.79 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.52 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.44 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  25.5 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  27.43 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.68 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  24.83 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.67 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.18 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.95 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.84 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.42 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0517  hypothetical protein  32.22 
 
 		 86 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  23.98 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.84 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  25.31 
 
 		 409 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  23.42 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.99 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.24 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.14 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.21 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.36 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  21.74 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.36 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  23.12 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>