219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3525 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  83.85 
 
 		 201 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  83.42 
 
 		 201 aa  341  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  83.85 
 
 		 192 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.54 
 
 		 189 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.79 
 
 		 192 aa  317  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.6 
 
 		 192 aa  313  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.26 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  78.26 
 
 		 192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.35 
 
 		 192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.49 
 
 		 196 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  76.44 
 
 		 202 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.26 
 
 		 192 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  77.72 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.72 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.74 
 
 		 201 aa  305  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.17 
 
 		 192 aa  304  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.16 
 
 		 199 aa  303  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.92 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.54 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.53 
 
 		 192 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  72.68 
 
 		 201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 		 192 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  76.09 
 
 		 192 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  72.31 
 
 		 194 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.37 
 
 		 200 aa  288  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.88 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.43 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  67.35 
 
 		 209 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.42 
 
 		 196 aa  280  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  68.45 
 
 		 191 aa  278  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.2 
 
 		 193 aa  277  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.09 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.2 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.37 
 
 		 196 aa  274  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.45 
 
 		 207 aa  274  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.26 
 
 		 190 aa  274  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.6 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.09 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.08 
 
 		 192 aa  271  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.11 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.11 
 
 		 195 aa  269  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.32 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.5 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.27 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.19 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.2 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.4 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  41.94 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  40.76 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.11 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40.88 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  41.05 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.12 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.92 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  36.98 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  32.45 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.45 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.45 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.19 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.69 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.7 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.46 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.97 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.61 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.6 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.06 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.34 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.68 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.32 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.95 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  30.97 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.82 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.35 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.29 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.88 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.97 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.06 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.88 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.43 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.74 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  36.89 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.06 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  31.3 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.14 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.54 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.94 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.72 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.53 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.51 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  28.82 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  25.64 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>