204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3281 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  85.42 
 
 		 193 aa  352  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  85.42 
 
 		 193 aa  352  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  86.24 
 
 		 207 aa  347  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  82.23 
 
 		 209 aa  338  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.98 
 
 		 190 aa  336  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.2 
 
 		 202 aa  333  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  84.04 
 
 		 191 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.37 
 
 		 199 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.84 
 
 		 198 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  77.13 
 
 		 201 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  77.66 
 
 		 194 aa  310  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  77.13 
 
 		 196 aa  300  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  74.19 
 
 		 202 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.66 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  68.09 
 
 		 194 aa  276  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  67.91 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.89 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  68.85 
 
 		 192 aa  269  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.4 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.85 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.95 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  66.67 
 
 		 201 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.4 
 
 		 192 aa  268  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.12 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.48 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  66.14 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.13 
 
 		 192 aa  257  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.57 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  64.48 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.48 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 		 196 aa  254  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.93 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.39 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.39 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.3 
 
 		 192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.95 
 
 		 189 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.21 
 
 		 192 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58.7 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.61 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58.15 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.38 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.64 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.08 
 
 		 210 aa  200  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.25 
 
 		 194 aa  191  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.63 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.25 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  44.89 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.88 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.2 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  39.23 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  40.11 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  38.46 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  38.67 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.61 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.17 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  32.08 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.08 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.08 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.49 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.49 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.12 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  30 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.11 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.7 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  28.05 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.75 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.7 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.9 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.19 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.36 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.9 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.37 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  32.09 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.12 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.09 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.49 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.33 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  33.73 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  32.56 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  24.05 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.92 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.11 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.99 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  27.69 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  24.52 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>