257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0452 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  98.31 
 
 		 177 aa  357  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  66.86 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.02 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  42.61 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.32 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  44.25 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.25 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.77 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.61 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  36.52 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.24 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.85 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.52 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.08 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.19 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  38.42 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.43 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.28 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.48 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.38 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.71 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  38.22 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.95 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.26 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.48 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  35.33 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.9 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.74 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.38 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.59 
 
 		 184 aa  97.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  35.76 
 
 		 409 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.45 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.55 
 
 		 227 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.06 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.45 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.45 
 
 		 197 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  33.33 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.85 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.83 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.22 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  28.48 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.83 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.83 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  28.77 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.7 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.26 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  28.08 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  26.58 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  25.71 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  27.45 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  29.03 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.31 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.03 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.39 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  26.35 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  25.68 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.98 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.76 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.39 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.01 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.16 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.15 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  41.67 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.8 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.85 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.34 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.21 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.67 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.34 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  24.4 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.04 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  25.85 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>