240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3877 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 200 aa  413  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  70.37 
 
 		 194 aa  288  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.31 
 
 		 192 aa  284  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.2 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  67.2 
 
 		 192 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  66.33 
 
 		 201 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.78 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.65 
 
 		 192 aa  275  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  67.38 
 
 		 192 aa  274  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  65.31 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  66.49 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 		 192 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  68.25 
 
 		 192 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 		 192 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 		 192 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  66.67 
 
 		 202 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.24 
 
 		 235 aa  264  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.59 
 
 		 192 aa  262  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.26 
 
 		 199 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.26 
 
 		 198 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.13 
 
 		 201 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.55 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.9 
 
 		 196 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  63.98 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.39 
 
 		 196 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  60.32 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.16 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 189 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.7 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  57.92 
 
 		 191 aa  235  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  57.98 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.24 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.61 
 
 		 202 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58.38 
 
 		 190 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.56 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.56 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.38 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.85 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.46 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.34 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.49 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.94 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.94 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  41.08 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  39.9 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.56 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.46 
 
 		 212 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  37.37 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  38.17 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.26 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.78 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.7 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  33.7 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.7 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.76 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.39 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.71 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.4 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.4 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.74 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.95 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.1 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.1 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.54 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  31.06 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.81 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  34.31 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.06 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  32.86 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.32 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.12 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.68 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  28.21 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  40.26 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.49 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  30.56 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  31.43 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  35.48 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.29 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.81 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.92 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.94 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.69 
 
 		 398 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  27.38 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.44 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9085  hypothetical protein  32.89 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9083  peroxidase family protein  33.57 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.99 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  25.88 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>