161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3885 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
369 aa  721    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  97.83 
 
 
369 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.42 
 
 
398 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.35 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  65.62 
 
 
196 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  68.06 
 
 
197 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  64.06 
 
 
199 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.58 
 
 
195 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.97 
 
 
196 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.45 
 
 
196 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.9 
 
 
196 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.58 
 
 
204 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.78 
 
 
197 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  63.3 
 
 
191 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.24 
 
 
197 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.59 
 
 
196 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  62.16 
 
 
197 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.62 
 
 
197 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.68 
 
 
371 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.33 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.69 
 
 
396 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.04 
 
 
372 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.53 
 
 
377 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.91 
 
 
377 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  31.82 
 
 
426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  31.82 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.78 
 
 
192 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  31.82 
 
 
426 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  45.16 
 
 
202 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.22 
 
 
191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  39.56 
 
 
200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  39.08 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.9 
 
 
202 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  39.57 
 
 
197 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.42 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.42 
 
 
210 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.11 
 
 
195 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  46.91 
 
 
176 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  44.91 
 
 
630 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  44.91 
 
 
626 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  27.79 
 
 
375 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  45 
 
 
635 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  27.49 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  27.49 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  42.26 
 
 
178 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  26.69 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  26.69 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  26.3 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  26.59 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  40.65 
 
 
173 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  26.59 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  26.28 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  39.76 
 
 
175 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  33.85 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  34.76 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  40.71 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  42.14 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  33.58 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.66 
 
 
185 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 
196 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.48 
 
 
212 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.61 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.4 
 
 
195 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.33 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  40.26 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.35 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  34.82 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.34 
 
 
217 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.85 
 
 
192 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  40.14 
 
 
176 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
192 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.87 
 
 
192 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  27.53 
 
 
202 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.68 
 
 
201 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.04 
 
 
214 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  38.96 
 
 
176 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.37 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.87 
 
 
200 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.17 
 
 
194 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  27.61 
 
 
192 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 
192 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.96 
 
 
209 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.32 
 
 
216 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  23.39 
 
 
201 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.91 
 
 
191 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  31.05 
 
 
208 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  28.21 
 
 
190 aa  59.7  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
192 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  29.85 
 
 
194 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.37 
 
 
192 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  28.36 
 
 
192 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  34.39 
 
 
167 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.87 
 
 
192 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  29.41 
 
 
191 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.18 
 
 
196 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  38.36 
 
 
176 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.1 
 
 
189 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.6 
 
 
192 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.09 
 
 
178 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>