168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4098 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  39.13 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.25 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.05 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.42 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  27.38 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.68 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  29.56 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  25.57 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  30.59 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.97 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.11 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.29 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.59 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.85 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.94 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.38 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.85 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  26.11 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.75 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  27.89 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.79 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  25.49 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.49 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.47 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.07 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.97 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  26.58 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4078  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.201946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.58 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.97 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.31 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.75 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  26.32 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.11 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9083  peroxidase family protein  30.77 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  30.92 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  26.39 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  27.43 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.57 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.29 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  26.47 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  26.17 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.53 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.4 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  27.89 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  32.29 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.55 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.31 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.24 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.72 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.53 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.43 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  24.85 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  34.07 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9085  hypothetical protein  32.46 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.64 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.16 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.28 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  24.69 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  26.8 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  21.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  26.04 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1680  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.9 
 
 		 371 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.85 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  30.47 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.81 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 		 377 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>