219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1250 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 177 aa  359  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  67.43 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  66.86 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.57 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.45 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.46 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.31 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.11 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  38.86 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.57 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.42 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  36.54 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  38.33 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.08 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.47 
 
 		 179 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.22 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  39.62 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.73 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.93 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.95 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.14 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  36.16 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  39.53 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.2 
 
 		 178 aa  97.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.38 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.06 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  35.5 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.6 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.29 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.12 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.71 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.91 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.26 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.19 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.59 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  32.53 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.13 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  32.72 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  31.84 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.92 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.27 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.48 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.75 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.66 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.48 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.5 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.75 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.98 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.52 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.86 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.52 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  27.75 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  36.89 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.25 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  27.88 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.78 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  27.68 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.65 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.96 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.88 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  25.6 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.22 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  27.81 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  26.88 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.65 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.83 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.66 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.26 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.78 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  27.22 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  33.66 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.06 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  25.5 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.89 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.85 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.22 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.3 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.75 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  24.71 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  25.88 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>