136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0320 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  54.89 
 
 		 185 aa  221  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  53.55 
 
 		 184 aa  217  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  52.75 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  50.56 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  47.49 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  49.17 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  47.25 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  48.33 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  46.03 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  54.17 
 
 		 151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  42.77 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.98 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.41 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  35.16 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  36.32 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  33.52 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  33.52 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  36.61 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.51 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.43 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  35.43 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.59 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.59 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  35.91 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  30.56 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.67 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.34 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.74 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  30.06 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.46 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  29.45 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.23 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.92 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  26.44 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.75 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.07 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.44 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.48 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.29 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.16 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.01 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  27.75 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.7 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  28.07 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  26.29 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  26.54 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.88 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  29.49 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  26.35 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  27.06 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  25.43 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.51 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  26.19 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.15 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25.75 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.55 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  23.35 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.63 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.1 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  26.54 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.14 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  23.68 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  24.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  25.66 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.2 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  26 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  23.75 
 
 		 409 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.08 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.46 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  23.75 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.77 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.84 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.88 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.84 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.29 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>