160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1625 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.79 
 
 
191 aa  244  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.13 
 
 
186 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.13 
 
 
186 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  50.84 
 
 
189 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 
191 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  42.77 
 
 
188 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.02 
 
 
197 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  36.46 
 
 
181 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  43.1 
 
 
184 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  39.05 
 
 
184 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  38.51 
 
 
185 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  34.81 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
183 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.36 
 
 
188 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  36.65 
 
 
207 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  36.72 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  36.72 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  36.72 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  35.84 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 
190 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  34.64 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  34.64 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.89 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.81 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  37.91 
 
 
198 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  35.59 
 
 
213 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.25 
 
 
179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 
179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
185 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 
179 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  31.46 
 
 
182 aa  97.8  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.74 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.42 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.48 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  35.34 
 
 
151 aa  90.9  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.97 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.9 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.72 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.46 
 
 
179 aa  84.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.34 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.4 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.82 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.46 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.81 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  29.94 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.46 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.91 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.81 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.12 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.97 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.72 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  31.08 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  34.81 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.74 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.47 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.1 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  26.47 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  27.5 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.03 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.59 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.05 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.99 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.45 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.24 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.65 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  25 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  25.58 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 
134 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.59 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  30.68 
 
 
135 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.76 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
135 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  26.35 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  26.62 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  25.58 
 
 
201 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.32 
 
 
192 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  32.1 
 
 
137 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.95 
 
 
176 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.32 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.26 
 
 
137 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.58 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.07 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.62 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>