159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3860 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  88.15 
 
 		 135 aa  245  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  88.14 
 
 		 118 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  73.68 
 
 		 134 aa  204  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  67.91 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.19 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  64.39 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  64.44 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  64.1 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  57.48 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.1 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.28 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.71 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.39 
 
 		 233 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.67 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.63 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.02 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  43.04 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.06 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  32.91 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  38.57 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.76 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.86 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  38.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  38.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.18 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.43 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  32.89 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  28.17 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  25.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.46 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  41.07 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  30.86 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.94 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.94 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.54 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  35.48 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.3 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  35.82 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1839  alkylhydroperoxidase AhpD  37.25 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.657831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.3 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.18 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.05 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  31.94 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.91 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.63 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  31.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  30.21 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.38 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.98 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.91 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.31 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.29 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.5 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  36.49 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.41 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  34.57 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.68 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0806  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  35.59 
 
 		 183 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.53 
 
 		 117 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.03 
 
 		 181 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.97 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.27 
 
 		 188 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 147 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35 
 
 		 216 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>