143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6113 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  82.68 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  49.72 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  53.14 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  46.93 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.61 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  47.49 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.93 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  46.93 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.2 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.05 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.15 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  38.76 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  36.52 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.71 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  37.71 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.22 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.2 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.26 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  32.77 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  37.2 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.59 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.83 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  41.01 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.27 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.31 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  32 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.74 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.96 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  36.47 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  33.14 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  35.85 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  37.29 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.94 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.15 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.01 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.48 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  32.57 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.58 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.73 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  29.24 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  31.13 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.28 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.65 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.56 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  30.61 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.71 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.33 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  36.69 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.48 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  29.55 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.32 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.7 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  27.43 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  30.61 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  27.43 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  31.08 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  27.06 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  27.17 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  25.43 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.43 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  26.16 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.22 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  28.85 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  25.43 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  32.46 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  28 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.36 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  26.01 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.65 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  21.64 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  28.16 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.38 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.7 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.15 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  25.56 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>