228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3837 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
172 aa  347  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  41.71 
 
 
183 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.24 
 
 
172 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  39.2 
 
 
177 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.16 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.1 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 
177 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  43.27 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  39.88 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.14 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  42.94 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  41.14 
 
 
183 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
178 aa  124  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.88 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.77 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  39.88 
 
 
172 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.03 
 
 
225 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 
183 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  36.18 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  37.74 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.55 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  36 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.36 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.73 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.84 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.33 
 
 
181 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.03 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  43.71 
 
 
409 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  40.13 
 
 
184 aa  104  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.12 
 
 
182 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  37.09 
 
 
180 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  38.67 
 
 
179 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.53 
 
 
227 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.31 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.85 
 
 
179 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.21 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.18 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
177 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.59 
 
 
179 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  35.12 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.65 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.81 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.28 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.84 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.96 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.96 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.01 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.38 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.56 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  32.56 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  32.88 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  29.81 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  31.74 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.3 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  34.18 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.35 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.49 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  30.67 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.38 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  31.21 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.39 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  31.07 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  29.22 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  33.72 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  30.19 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.67 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  28.3 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  31.06 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  29.8 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.03 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.61 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  27.93 
 
 
209 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.12 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.5 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.43 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.06 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.25 
 
 
207 aa  60.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  25.79 
 
 
185 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 
192 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.95 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.29 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.51 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.86 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.22 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.99 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.4 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>