173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6510 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  99.47 
 
 		 207 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  97.87 
 
 		 198 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  75.66 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  72.87 
 
 		 211 aa  275  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  64.55 
 
 		 190 aa  230  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  62.09 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  58.24 
 
 		 208 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  57.69 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  57.14 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  58.01 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  58.01 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  54.14 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  36.56 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  34.1 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  35.16 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  32.42 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36.93 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  35.26 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  34.07 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.52 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.99 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  34.1 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  33.91 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  31.32 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.34 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.35 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.18 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.57 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  28.18 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.28 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.93 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.14 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.79 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.72 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.28 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.78 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.71 
 
 		 227 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.85 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.22 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.89 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.14 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.12 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  32.73 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.12 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.38 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  27.68 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.37 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  32.56 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.3 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.15 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.49 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.71 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  28.08 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.08 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  28.08 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.29 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.82 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.43 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  24.85 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.26 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.88 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.76 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.81 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  25.7 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  22.86 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.49 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.87 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.2 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.73 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  26.82 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.87 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.31 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  24.59 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.86 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  27.54 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.31 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  24.85 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  24.06 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  25.7 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>