299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0970 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
183 aa  358  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  54.64 
 
 
183 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.37 
 
 
182 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  44.26 
 
 
183 aa  174  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.29 
 
 
178 aa  174  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.14 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  44 
 
 
225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.09 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 
178 aa  161  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  47.98 
 
 
172 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  41.71 
 
 
181 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.97 
 
 
184 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.86 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  46.02 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.66 
 
 
172 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 
178 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  45.76 
 
 
183 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
177 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  45.09 
 
 
172 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.02 
 
 
181 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  46.89 
 
 
180 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.43 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.91 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  44.32 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 
172 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
181 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  48.1 
 
 
184 aa  134  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  49.01 
 
 
409 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.29 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.35 
 
 
227 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.71 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  36.57 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  37.28 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 
179 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  37.36 
 
 
180 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.49 
 
 
179 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.1 
 
 
211 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  31.06 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.06 
 
 
179 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  31.06 
 
 
179 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.41 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.98 
 
 
178 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.53 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.34 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.9 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  30.64 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.73 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  29.88 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.21 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  30.81 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.84 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.84 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.46 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  30.64 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  30.23 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.74 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  29.65 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.49 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.81 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  30.29 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.62 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.55 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  30.64 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.25 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  27.43 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  25.58 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  28.92 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  25.29 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.32 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  29.24 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  29.76 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  29.25 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  25.65 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.24 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.24 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.34 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.36 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.03 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.76 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.76 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  29.76 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  27.88 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  28.4 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  29.17 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>