144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3639 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  94.69 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  99.46 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  72.58 
 
 		 205 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  73.33 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  61.08 
 
 		 189 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.45 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  53.92 
 
 		 207 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  58.33 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.14 
 
 		 188 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  56.74 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  57.14 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  48.88 
 
 		 182 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  141  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  39.36 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  34.27 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  35.91 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  35.75 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  33.89 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.11 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.21 
 
 		 172 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.1 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.92 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.92 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.02 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.26 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.98 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.68 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.67 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.86 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.54 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.73 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.71 
 
 		 181 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.13 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.29 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 172 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.54 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.88 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.21 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  29.61 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.74 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.59 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  30.59 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  30.59 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.9 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.46 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  31.06 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  32.28 
 
 		 409 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.12 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  31.67 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.41 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.91 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.42 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.43 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  30.41 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.09 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.03 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.86 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.86 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25.77 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  26.97 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.14 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.73 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.65 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.15 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  30.61 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.93 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.81 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  25.15 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.15 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.67 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  26.4 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  24.66 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  26.03 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.72 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.61 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.14 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.54 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>