174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2694 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  59.79 
 
 		 189 aa  244  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.72 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.72 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  51.57 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  40.49 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  39.41 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  39.78 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  39.29 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  37.71 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  35.37 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  39.26 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  37.13 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.52 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.52 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.7 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  37.95 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  32.07 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.15 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  37.91 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.91 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  37.91 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  34.07 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  43.97 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.18 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.69 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.09 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.37 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  35.39 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.26 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.9 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.51 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.49 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  29.88 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.43 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 177 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.85 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.58 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.22 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.48 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.01 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.48 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.91 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  32.16 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.86 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.16 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.25 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.71 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.29 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  28.65 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  27.98 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  32.69 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  28.39 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.05 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  27.1 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.56 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  29.56 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  27.61 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.74 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.1 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.34 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  26.62 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  28.31 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.17 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  29.03 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.85 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.85 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.05 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.03 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.49 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.1 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.38 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  29.93 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.16 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>