133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4635 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  86.26 
 
 		 182 aa  326  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  63.19 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.36 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.4 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  33.15 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  31.67 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  28.89 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.69 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  31.67 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.35 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  32.6 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  32.04 
 
 		 219 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.07 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  31.87 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  31.87 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  30.39 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  29.44 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  29.44 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  29.12 
 
 		 190 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.28 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  31.11 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  28.73 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.1 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 		 213 aa  90.9  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.07 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.71 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.81 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.33 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.31 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.16 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.4 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  29.83 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.85 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.67 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.5 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.65 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.65 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.33 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  24.28 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.65 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  26.51 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  29.31 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  24.71 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.75 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.74 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.32 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.07 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.95 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.48 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.48 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.08 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  27.01 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.95 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  33.03 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  25.49 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.47 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  25.49 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  25.32 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  26.79 
 
 		 409 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  23.17 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  25.32 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.31 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  24.02 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.97 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  22.65 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.26 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.65 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  22.01 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.76 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.76 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  22.54 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.61 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.16 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.99 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.67 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.26 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.85 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.67 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.56 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  22.99 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  23.49 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.97 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  22.41 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.41 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.64 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.78 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  22.81 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>