239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6700 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  52.38 
 
 
172 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.38 
 
 
172 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  48.02 
 
 
177 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  48.02 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  50.6 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.95 
 
 
172 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.13 
 
 
178 aa  151  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  49.14 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  44.32 
 
 
180 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.71 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  41.24 
 
 
172 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
177 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  44.63 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.63 
 
 
182 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
181 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  41.48 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 
182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.5 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  43.04 
 
 
183 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.77 
 
 
178 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.63 
 
 
178 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.85 
 
 
225 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.07 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.98 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.95 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 
184 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.43 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  36.48 
 
 
178 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.43 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.29 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.93 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.68 
 
 
179 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.66 
 
 
184 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 
179 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.23 
 
 
178 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  33.52 
 
 
192 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  37.75 
 
 
180 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.98 
 
 
177 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.67 
 
 
227 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  38.55 
 
 
175 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  30.81 
 
 
180 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.9 
 
 
184 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.73 
 
 
211 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  41.5 
 
 
409 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.13 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.78 
 
 
189 aa  94.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  32.18 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  32.95 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.64 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  30.23 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.53 
 
 
213 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
208 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
219 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  32.37 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  31.76 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  29.34 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  30.49 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  34.69 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  32 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.95 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.69 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.75 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.75 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.16 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.37 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.18 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  27.67 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.55 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  32.35 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  32.16 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.94 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.61 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.12 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  28.24 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.84 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  30.72 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.84 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  31.29 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  29.25 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>