259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0520 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  63.89 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  59.44 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  57.92 
 
 		 183 aa  201  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  60.48 
 
 		 409 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.86 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  52.9 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  94.05 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.16 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  46.07 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.98 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  46.93 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.51 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.47 
 
 		 225 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.17 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.98 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.17 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.05 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  41.14 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  42.61 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  42.61 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  50.31 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.1 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  45.16 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  39.49 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.88 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.25 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.27 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.22 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.61 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.22 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.36 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  37.29 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  35.2 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.25 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.38 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  37.08 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.76 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.06 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  35.06 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.67 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.46 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 		 190 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  37.11 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  36.09 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.18 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  33.73 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.61 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.54 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  38.42 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.9 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  30.59 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  32.76 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.75 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  30.29 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.13 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.13 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  30.91 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  29.45 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  31.29 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.02 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  27.75 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  29.48 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.24 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.25 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.03 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.7 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.86 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  25.75 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.29 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.7 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  26.59 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.78 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.78 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.41 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.54 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>