220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3064 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
192 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  85.94 
 
 
192 aa  352  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  83.33 
 
 
192 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  83.33 
 
 
192 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  81.77 
 
 
192 aa  338  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.81 
 
 
192 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.81 
 
 
192 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.29 
 
 
192 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  81.77 
 
 
192 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  84.24 
 
 
189 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  79.89 
 
 
201 aa  314  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  78.26 
 
 
194 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.48 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.96 
 
 
192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  77.17 
 
 
201 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.16 
 
 
192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.87 
 
 
192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.09 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  75.14 
 
 
202 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.73 
 
 
198 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.59 
 
 
196 aa  298  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  76.92 
 
 
192 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  72.54 
 
 
201 aa  296  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.59 
 
 
201 aa  294  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  70.97 
 
 
194 aa  287  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.84 
 
 
189 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.88 
 
 
195 aa  280  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.2 
 
 
200 aa  279  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.02 
 
 
235 aa  278  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.23 
 
 
196 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.75 
 
 
196 aa  276  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.8 
 
 
192 aa  275  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  69.23 
 
 
191 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.75 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 
207 aa  271  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.95 
 
 
193 aa  270  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.85 
 
 
192 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.95 
 
 
193 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.61 
 
 
202 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  65.96 
 
 
209 aa  264  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 
190 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.26 
 
 
202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.23 
 
 
194 aa  208  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.15 
 
 
210 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.37 
 
 
228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 
216 aa  177  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.86 
 
 
217 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.62 
 
 
212 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  39.8 
 
 
201 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.67 
 
 
191 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  160  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  41.3 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  36.9 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.02 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.78 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.5 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  29.03 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.03 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.03 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.56 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.82 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.82 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  35.07 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.82 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.87 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  33.82 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.09 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.58 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  26.16 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  30.13 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  26.74 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.9 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.82 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.45 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.59 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  32.82 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.05 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.93 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.61 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.75 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  31.16 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.21 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.29 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.3 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  26.67 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.49 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.82 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.04 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>