216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3349 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  88.56 
 
 
201 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  83.42 
 
 
194 aa  341  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  82.29 
 
 
192 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.42 
 
 
192 aa  318  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.84 
 
 
189 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  80.43 
 
 
192 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.21 
 
 
192 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.89 
 
 
192 aa  314  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  79.68 
 
 
192 aa  313  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.68 
 
 
192 aa  313  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.89 
 
 
192 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.03 
 
 
192 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.54 
 
 
192 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  75.53 
 
 
192 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.2 
 
 
199 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  76.06 
 
 
202 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.64 
 
 
196 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.16 
 
 
198 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  70.79 
 
 
201 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.06 
 
 
201 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.77 
 
 
192 aa  296  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.68 
 
 
192 aa  295  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  70.37 
 
 
194 aa  292  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.11 
 
 
192 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  69.35 
 
 
191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.11 
 
 
192 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  67.18 
 
 
209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.21 
 
 
193 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.21 
 
 
193 aa  279  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.91 
 
 
192 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 
190 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.32 
 
 
202 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.45 
 
 
196 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.65 
 
 
195 aa  274  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.32 
 
 
207 aa  274  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.26 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.31 
 
 
200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 
192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.57 
 
 
235 aa  266  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.54 
 
 
189 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.25 
 
 
196 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.85 
 
 
210 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.52 
 
 
202 aa  207  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.25 
 
 
194 aa  205  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.7 
 
 
228 aa  202  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.31 
 
 
216 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.22 
 
 
217 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  40.22 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.58 
 
 
214 aa  161  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  158  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.56 
 
 
191 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.34 
 
 
212 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  40.22 
 
 
191 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  36.41 
 
 
195 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.75 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.04 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.04 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.82 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.06 
 
 
172 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.37 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  27.06 
 
 
172 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.7 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.5 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.82 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.08 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.08 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  31.34 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.22 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  28.22 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.56 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  28.68 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.07 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.34 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  23.46 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.07 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.79 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.36 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.28 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  27.62 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.3 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  25.29 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.76 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.48 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  29.24 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>