144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0301 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
137 aa  282  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  71.97 
 
 
134 aa  205  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  70.9 
 
 
135 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  68.15 
 
 
137 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  65.19 
 
 
135 aa  183  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  61.48 
 
 
135 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  63.64 
 
 
132 aa  179  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  63.79 
 
 
118 aa  166  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  61.16 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.62 
 
 
130 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  54.26 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.85 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.14 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.01 
 
 
233 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.84 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.78 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40 
 
 
216 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  33.7 
 
 
192 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.75 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
192 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.7 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.65 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  32.17 
 
 
192 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 
189 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  31.48 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.21 
 
 
217 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.61 
 
 
192 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.7 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  32.67 
 
 
192 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.67 
 
 
192 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.67 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 
201 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.67 
 
 
192 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  31.93 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.78 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 
147 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  37.21 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  33.7 
 
 
202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  32.97 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.63 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.14 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.18 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
198 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  31.52 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.69 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.11 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  33.68 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.35 
 
 
192 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.35 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.82 
 
 
225 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  40.98 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.25 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.57 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.33 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  25.81 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.04 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  32.26 
 
 
201 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  35 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  28.28 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  31.18 
 
 
194 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  32.99 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.97 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.67 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.61 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 
228 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.62 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.93 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.29 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.51 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.33 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  28.75 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  30.93 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>