130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0152 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
137 aa  283  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  73.68 
 
 
134 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  67.91 
 
 
135 aa  200  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  67.16 
 
 
135 aa  196  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  68.15 
 
 
137 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  65.15 
 
 
132 aa  183  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  68.38 
 
 
118 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.69 
 
 
135 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.37 
 
 
130 aa  153  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  58.62 
 
 
143 aa  153  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.32 
 
 
130 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  54.03 
 
 
130 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.02 
 
 
130 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0188  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.98 
 
 
233 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.83 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.48 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 
211 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.67 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 
189 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  32.04 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.97 
 
 
180 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.46 
 
 
225 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.86 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 
110 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  34.57 
 
 
112 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
144 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.92 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  43.55 
 
 
157 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.89 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.92 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.89 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  30.53 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.67 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.5 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.45 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  27.5 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.41 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1839  alkylhydroperoxidase AhpD  31.08 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.657831  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  45.24 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  36.07 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 
192 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.47 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  43.1 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.43 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.73 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
207 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  35.82 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.3 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  32.56 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  28.44 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.91 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.21 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  35.62 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  39.62 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 
388 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  35.62 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  42.62 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.75 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.88 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.93 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.32 
 
 
145 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.9 
 
 
372 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  37.04 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.04 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.87 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  37.04 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.1 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.71 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  30.59 
 
 
201 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  41.07 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.98 
 
 
217 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.9 
 
 
216 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>