97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4256 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  52.59 
 
 
147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
134 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  37.69 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.05 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4347  alkylhydroperoxidase AhpD  46.23 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.88 
 
 
176 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.17 
 
 
178 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  36.47 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.49 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  32.08 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.6 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  40.45 
 
 
115 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.5 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 
177 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.67 
 
 
184 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.15 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.94 
 
 
111 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.31 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
116 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  30.36 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.34 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.9 
 
 
126 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 
111 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 
111 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  35.71 
 
 
119 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.78 
 
 
122 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  31 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2036  alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.91 
 
 
110 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  36.36 
 
 
98 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.94 
 
 
120 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  31.67 
 
 
130 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.73 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
108 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.46 
 
 
114 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  44 
 
 
113 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
109 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.92 
 
 
130 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.74 
 
 
113 aa  44.3  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 
111 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.16 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.21 
 
 
110 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  45.83 
 
 
113 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
118 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.61 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.6 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
109 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
115 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 
107 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  32.14 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  44.9 
 
 
114 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  32.1 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.9 
 
 
117 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 
112 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 
117 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  31.71 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.81 
 
 
112 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
110 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.71 
 
 
184 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.83 
 
 
225 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.63 
 
 
114 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.73 
 
 
137 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
114 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  38.18 
 
 
109 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.23 
 
 
184 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 
111 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.94 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 
111 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  27.55 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.53 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 
115 aa  41.6  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  30.49 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.4 
 
 
113 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
113 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
113 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  32.39 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.43 
 
 
110 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
113 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
113 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
120 aa  41.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0647  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.82 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.405767  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  48.94 
 
 
112 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  48.94 
 
 
112 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
110 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.59 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>