135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0248 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 150 aa  311  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  70.92 
 
 		 163 aa  217  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  61.31 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.1 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  56.92 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  41.35 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  36.59 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  41.41 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  37.35 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  37.35 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  37.35 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.02 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.55 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.39 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  36.14 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.8 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  34.94 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.73 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.88 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.78 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  33.96 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  34.85 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  34.88 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  34.88 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  28.3 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  33.71 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.46 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.53 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.96 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.36 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.09 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  30.09 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  30.09 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  30.93 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  36.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.11 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.81 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.49 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1129  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  32.61 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.04 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  27.18 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.12 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.91 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.81 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  33.72 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  40.68 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>