86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1559 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  39.05 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.41 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.38 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  33.03 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  35.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.98 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.28 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
126 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.28 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 
121 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.82 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  30.69 
 
 
111 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  47.27 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.05 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.91 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.05 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2050  carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
113 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 
114 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  26.23 
 
 
116 aa  47.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  35.29 
 
 
117 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
114 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.91 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  31.52 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  42.42 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  42.42 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
125 aa  43.5  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  41.82 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.36 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.47 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.47 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.47 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.47 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.1 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.31 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  27.78 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  32.81 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  32.81 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.18 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  43.64 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.87 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  25.83 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  41.07 
 
 
295 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.81 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
112 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
147 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.09 
 
 
111 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>