140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1281 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  48.75 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  44.44 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.3 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  47.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.76 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  44.07 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.35 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.07 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.31 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  40.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  37.66 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.62 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  38.67 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  38.67 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1758  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.28 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.736149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  34.12 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.59 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  31.17 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.59 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  31.17 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.72 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.88 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  39.06 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  39.06 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  53.19 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  41.07 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  27.72 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  37.97 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  41.07 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.21 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.94 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.51 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.26 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  37.25 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.47 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  41.82 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  46.3 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  32.94 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.52 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.92 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  34.85 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.87 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.85 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.71 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  41.82 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  41.82 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  31.17 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.6 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.17 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.25 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  31.17 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1781  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.73 
 
 		 114 aa  47.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  35.38 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  40.35 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  31.08 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>