58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2449 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2449  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 89 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00215332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  52.31 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1378  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1758  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.14 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.736149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0547  hypothetical protein  43.14 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.55 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.47 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.55 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3145  carboxymuconolactone decarboxylase  36.21 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4057  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.9 
 
 		 384 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  32.14 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  33.93 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  29.17 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  42.5 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.53 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  38.18 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.14 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.64 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.32 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.54 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.15 
 
 		 111 aa  40.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.08 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  39.02 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.55 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  30.65 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>