174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4192 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.74 
 
 
113 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  66.04 
 
 
117 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  66.98 
 
 
114 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  66.98 
 
 
109 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  66.04 
 
 
109 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  66.04 
 
 
109 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  66.04 
 
 
109 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  66.04 
 
 
109 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  66.04 
 
 
109 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  66.67 
 
 
108 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  64.15 
 
 
114 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.72 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  63.55 
 
 
110 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.55 
 
 
114 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  58.88 
 
 
112 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  55.96 
 
 
115 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.47 
 
 
111 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.47 
 
 
111 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  54.46 
 
 
115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.73 
 
 
122 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  58.72 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  57.01 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  55.14 
 
 
114 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  55.14 
 
 
114 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.55 
 
 
113 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  57.55 
 
 
113 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  57.55 
 
 
113 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  54.63 
 
 
114 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  56.6 
 
 
113 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  56.6 
 
 
113 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.94 
 
 
110 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.33 
 
 
113 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.38 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.1 
 
 
117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.81 
 
 
126 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
126 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.9 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  44.76 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.9 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  47.62 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  47.62 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.28 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.19 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  41.84 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  45.19 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  39.42 
 
 
118 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  50.96 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.38 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.91 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  37.74 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 
123 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
123 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  40.38 
 
 
125 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  35.24 
 
 
113 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  49.04 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  36.89 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  36.89 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  36.79 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.53 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.53 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  33.98 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.14 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  39.78 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  35.54 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.58 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  44.9 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.54 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  36.67 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  42.72 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.01 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.05 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.01 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.99 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  43.53 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.99 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.99 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.99 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.65 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  40.78 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  33.98 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  35.92 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.53 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  34.91 
 
 
424 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.36 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  37 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.36 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.73 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  42.39 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>