155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1981 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  83.78 
 
 		 111 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  56.76 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  56.76 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.15 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  49.55 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  49.55 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.65 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  52.78 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.82 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.14 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  55.77 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.77 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  55.77 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  55.77 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  55.77 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.93 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  57 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  54.81 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  50.96 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  50 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  50.48 
 
 		 115 aa  100  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  49.07 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  51.46 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.83 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.83 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  49.55 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  51.46 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.49 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.43 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  50.49 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.08 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  50.94 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.35 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.3 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.48 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  41.44 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.74 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  41.05 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  73.53 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.05 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.04 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  36.61 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  34.55 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  36.56 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.35 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.14 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.45 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  52.17 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  39.53 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  39.64 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  35.45 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  37.27 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  38.74 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  37.04 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  34.65 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  34.65 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.03 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  33.94 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.03 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.74 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.48 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.03 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  29.36 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  36.79 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  30.1 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.07 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  39.76 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.31 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  40 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  41.46 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.51 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.65 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  41.03 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.81 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.81 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.81 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>