155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0604 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  99.14 
 
 
211 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
116 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  99.14 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  97.41 
 
 
203 aa  214  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
104 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
104 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
104 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
104 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  69.37 
 
 
115 aa  167  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  71.96 
 
 
115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.88 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  64.49 
 
 
424 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  52.73 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  54.21 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  53.15 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.75 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.11 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  49.11 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  53 
 
 
113 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  53 
 
 
113 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.85 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
125 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.24 
 
 
117 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.05 
 
 
120 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  45.45 
 
 
148 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  46.08 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  42.73 
 
 
150 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  42.73 
 
 
153 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  42.2 
 
 
113 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.55 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  52.22 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  38.53 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.96 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  36.28 
 
 
113 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  36.7 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.45 
 
 
109 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  36.19 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  36.19 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.19 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  36.19 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  36.19 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.11 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  37.61 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  37.61 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  41.11 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  38.68 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.25 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  33.01 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  36.45 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  38.53 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  36.61 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  38.68 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  43.96 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.26 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.26 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  38.78 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.29 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  36.47 
 
 
268 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.64 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  34.26 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.58 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  35.56 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.21 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  37.36 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  41.56 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.71 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.96 
 
 
111 aa  67  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.45 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  35.45 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  34.12 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.51 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  41.25 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  29.67 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5993  alkylhydroperoxidase AhpD  42.47 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  33.02 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>