186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3748 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  65.79 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  63.3 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.91 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.73 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  60.2 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  48.11 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.27 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  52.43 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  52.73 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  45.87 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  47.71 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  50.48 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.15 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.76 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  53.76 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.55 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  44.66 
 
 		 113 aa  91.3  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  52.75 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.06 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.05 
 
 		 117 aa  84.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.94 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  47.25 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  36.45 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  43.16 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.94 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.43 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  46.43 
 
 		 268 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.49 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  43.3 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  41.9 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.53 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  43.33 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  42.39 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  40.95 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  40.22 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.1 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  45.24 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  40.78 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.76 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  39.6 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  44.71 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  33.04 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.41 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.36 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.46 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.66 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.66 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  31.36 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  31.36 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  39.22 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  39.22 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  33.03 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  40.62 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  42.27 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.95 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  39.32 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  41 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  39.78 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  37.89 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.79 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  36.89 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  42.05 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  33.04 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.96 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.05 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  41.77 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.25 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.46 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 424 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>