162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4255 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  72.48 
 
 		 113 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  72.48 
 
 		 113 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  73.15 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  73.15 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  73.15 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  67.29 
 
 		 109 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  64.49 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  66.36 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  66.36 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  66.36 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  66.36 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  66.36 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  63.55 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  66.67 
 
 		 108 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  64.81 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.96 
 
 		 114 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  60.91 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  60.91 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.68 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  60.91 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.63 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.88 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.88 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  56.19 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  52.73 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  56.48 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  53.27 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  49.54 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  49.54 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  49.54 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.88 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.73 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  43.52 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.52 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.45 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.52 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.22 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.2 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  42.99 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.99 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  42.2 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.23 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.93 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 		 115 aa  95.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.24 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  42.45 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.17 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.45 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  44.04 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  44.04 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  50.93 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  45.05 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  45.05 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.95 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  37.96 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  41.24 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  37.61 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.41 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.46 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.96 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.96 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.96 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.96 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  61.54 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  39.25 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  36.7 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  41.35 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  38.04 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  36.45 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  40.38 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  33.02 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  33.02 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  35.45 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  32.08 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  34.88 
 
 		 268 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  39.13 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.65 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  33 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  41.76 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  37.35 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 424 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  37.74 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  28.18 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.97 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>