177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0412 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
112 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  66.36 
 
 
113 aa  149  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  62.62 
 
 
117 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  60.71 
 
 
114 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  60.71 
 
 
114 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  64.81 
 
 
110 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.55 
 
 
109 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.93 
 
 
114 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.62 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  62.62 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  62.62 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  62.62 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  62.62 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  63.55 
 
 
115 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  58.88 
 
 
119 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  62.26 
 
 
108 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  57.94 
 
 
115 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  57.66 
 
 
115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  60.95 
 
 
114 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.7 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.18 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  58.18 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  58.18 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  58.18 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  56.25 
 
 
113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  58.18 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.41 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.41 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  56.19 
 
 
113 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  52.68 
 
 
114 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  52.68 
 
 
114 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.81 
 
 
122 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.29 
 
 
110 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  49.54 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  49.54 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.12 
 
 
119 aa  103  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.14 
 
 
117 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.59 
 
 
123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.05 
 
 
112 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  40.74 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.05 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.37 
 
 
120 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.51 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  41.51 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  42.06 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  47.22 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  42.73 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  55.14 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.54 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  43.43 
 
 
149 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
115 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  38.53 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  43.56 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.18 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  36.7 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  57 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.2 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.57 
 
 
117 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  36.45 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  38.39 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  35.78 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.7 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.7 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.7 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.84 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.64 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  35.19 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  35.19 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  34.26 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  39.56 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0068  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 
424 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  37.37 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  37.37 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  40.23 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.23 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.55 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.66 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  40.58 
 
 
268 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.09 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  32.11 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.97 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.65 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>