201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1580 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  69.81 
 
 		 113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.53 
 
 		 109 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  73.58 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  73.58 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  73.58 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  73.58 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  73.58 
 
 		 109 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  73.33 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  66.37 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  66.37 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.73 
 
 		 114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  58.72 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  64.15 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  59.29 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  64.15 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  62.39 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  64.15 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.46 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  58.33 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  55.75 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  58.33 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  56.76 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  56.76 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  56.48 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  53.7 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.72 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.63 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.79 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  47.79 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.95 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  47.79 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.75 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.98 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.59 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.28 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  40.37 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.22 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.82 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  41.9 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  48.65 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.59 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.7 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.74 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  37.74 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  38.53 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.73 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  36.73 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  40.4 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.14 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  40.19 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.46 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.02 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  34.55 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  35.11 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  37.23 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  36.27 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  35.19 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  36.54 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  36.17 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  35.58 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.5 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 211 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  39.47 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.73 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.59 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.59 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  35.92 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.59 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.59 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>