183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6153 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  69.3 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  62.86 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  62.86 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  64.76 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.76 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  64.76 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  64.76 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  64.76 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.81 
 
 		 109 aa  136  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.86 
 
 		 113 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  60.95 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  63.11 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  59.81 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.76 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  59.05 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.33 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.33 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  55.14 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  52.68 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  52.68 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  52.34 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  52.73 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.77 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  54.63 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.54 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.63 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.09 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  49.09 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  49.09 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.85 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  45.95 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  45.95 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  49.55 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.19 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  44.95 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.95 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.44 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  39.47 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.6 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.64 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  38.74 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.47 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.94 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  41 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.23 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  40.66 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  39.77 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.43 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  35.29 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.64 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  41.94 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  32.99 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.38 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  36.08 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  35.35 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  36.14 
 
 		 268 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  27.03 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.89 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  26.36 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  35.85 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.85 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.78 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.67 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.82 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  38.64 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.37 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  34.91 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.67 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.67 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>