110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0601 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  92.59 
 
 		 108 aa  206  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5993  alkylhydroperoxidase AhpD  37.27 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  37.5 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  45.31 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  31.87 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  29.03 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.26 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.94 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.44 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.37 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.52 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.34 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.4 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  32.53 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.47 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  34.09 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1150  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  34.94 
 
 		 268 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  23.3 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.94 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.21 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.04 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.88 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.12 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  35.21 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  29.58 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  29.21 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  32.39 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.52 
 
 		 109 aa  43.9  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  22.78 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  29.49 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  38.98 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  30.16 
 
 		 100 aa  43.5  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.5 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.5 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.51 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.21 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.17 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  41.67 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5610  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.070686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  32.1 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.92 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.98 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  31.51 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.66 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  32.53 
 
 		 111 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>