167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2454 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  75.68 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  70.8 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  75.7 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.11 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  46.05 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  36.7 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  34.04 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  41.46 
 
 		 144 aa  57  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  36.47 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  34.15 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.12 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.29 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  30.21 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  40.28 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  35.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  32.94 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.97 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  36 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0411  alkylhydroperoxidase AhpD  28.57 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331538  normal  0.0612182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.02 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  30.49 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.04 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  29.17 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.91 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  32.65 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  27 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  36.05 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  32.22 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  29.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  44.64 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  26.26 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  40.28 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  41.79 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.12 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.21 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  35.82 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.92 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.24 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.73 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  29.36 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  26.21 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.74 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.17 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.49 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  26.17 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.89 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  30.12 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0569  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000038073  normal  0.6308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  31.18 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  25.24 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.49 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  25.49 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.77 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  30.21 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  28.42 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1026  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.51 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  30.11 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>