25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0617 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.23 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.53 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.78 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.17 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.92 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.29 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  36.05 
 
 		 115 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  23.64 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  24.68 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  32.18 
 
 		 116 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  23.72 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  22.05 
 
 		 130 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  24.48 
 
 		 336 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  31.76 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.83 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.95 
 
 		 137 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  24 
 
 		 132 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.85 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  20.37 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  25.71 
 
 		 344 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>